Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrc5C3VPR6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc5C3VPR6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms