Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cttnbp2B9EJA2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms