Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm6133B2RY53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm6133B2RY53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm6133B2RY53 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms