Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clrn2B2RVW2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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