Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc8B2RUS7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Abcc8B2RUS7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Abcc8B2RUS7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc8B2RUS7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms