Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms