Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn7aB1AYL1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn7aB1AYL1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms