Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NhsB1AV60 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NhsB1AV60 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NhsB1AV60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms