Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trabd2bB1ATG9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trabd2bB1ATG9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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