Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Grik3B1AS29 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik3B1AS29 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms