Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-M5A7VMS3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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H2-M5A7VMS3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2-M5A7VMS3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2-M5A7VMS3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H2-M5A7VMS3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M5A7VMS3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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