Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b5A3FIN4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b5A3FIN4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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