Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klhl41A2AUC9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl41A2AUC9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl41A2AUC9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl41A2AUC9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl41A2AUC9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl41A2AUC9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl41A2AUC9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl41A2AUC9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl41A2AUC9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl41A2AUC9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl41A2AUC9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl41A2AUC9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms