Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef25A2ASI9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramef25A2ASI9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms