Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tubb1A2AQ07 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tubb1A2AQ07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tubb1A2AQ07 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tubb1A2AQ07 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms