Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SetxA2AKX3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms