Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms