Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpc1lA2A5N3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
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