Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms