Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VarsQ9Z1Q9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VarsQ9Z1Q9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VarsQ9Z1Q9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VarsQ9Z1Q9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms