Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lgr5Q9Z1P4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms