Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfrp4Q9Z1N6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms