Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nup160Q9Z0W3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup160Q9Z0W3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup160Q9Z0W3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms