Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim3Q9R1R2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms