Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc3Q9R0B6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lamc3Q9R0B6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Lamc3Q9R0B6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms