Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsjQ9R014 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms