Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf10bQ9QZM4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms