Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC3

Bhlha15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha15Q9QYC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlha15Q9QYC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlha15Q9QYC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms