Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp3Q9QY23 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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