Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxe3Q9QY14 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxe3Q9QY14 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxe3Q9QY14 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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