Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpsf3Q9QXK7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpsf3Q9QXK7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms