Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dkk3Q9QUN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms