Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf1Q9QUM4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slamf1Q9QUM4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms