Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclk1Q9JLM8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dclk1Q9JLM8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dclk1Q9JLM8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms