Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Alyref2Q9JJW6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Alyref2Q9JJW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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