Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Riok3Q9DBU3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riok3Q9DBU3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms