Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrpraQ9DBG7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrpraQ9DBG7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms