Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TrmuQ9DAT5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrmuQ9DAT5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms