Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scp2d1Q9DAH1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scp2d1Q9DAH1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms