Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift43Q9DA69 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift43Q9DA69 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms