Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms