Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp5Q9D7S9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms