Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf1dQ9D4V4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1dQ9D4V4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms