Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lonrf3Q9D4H7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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