Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
9330161L09RikQ9D253 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9330161L09RikQ9D253 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms