Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nol3Q9D1X0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nol3Q9D1X0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nol3Q9D1X0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms