Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem53Q9D0Z3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms