Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms