Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Shmt2Q9CZN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shmt2Q9CZN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms