Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mis12Q9CY25 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms